网友 @保福寺里的研究僧 发现了Word中拼音和文字一起被输入的问题系由EndNote引起，他联系了EndNote厂商Thomson Reuters汤森路透，以下是汤森路透的官方回复：
At present, the only workaround is to unformat the document and turn off the instant formatting when inserting citations. This will insert the citation in temporary format and no bibliography will be generated and hence no field codes in the document.
@保福寺里的研究僧 研究的解决办法：
endnote的原理是这样，一旦有文献更新或者文档输入有更新的时候，endnote会对整个文档里的引用文献进行重新编译，类似Latex。但是这也同时导致了endnote的另外一个问题，就是很多时候用endnote插入文献的word一打开，机器就会变的很慢。这个也是因为endnote对文献的重新编译索引所导致的，endnote每次发现word有更新了，然后就开始重新编译索引，我现在能感觉到的是，输入有停顿时，就会出现之前提到的状况，也就是说，刚好这个输入的时间在他重新check文档变化的频率范围之内。
所以要解决这个问题，我目前找到了一个比较相对可行的办法，就是把endnote的自动编译索引关掉，一方面可以杜绝使用endnote插入文献后的word变慢，另外一方面则可以使得输入法可用。
两步可以解决
“1.在Endnote工具栏里Tools-Cite While You Write-CWYW Preferences,General选项卡，勾选掉Enable Instant Formatting on new Word documents.这样可以避免Endnote反复检查文档。
2.在Endnote工具栏里Tools-Cite While You Write-Format Bibliography，Instant Formatting选项卡中，把这个功能给turn off掉”。
这两个设置都是涉及到endnote对文档自动进行扫描操作以及重新索引操作的，把这两个关掉，输入法就可以用了
我的endnote是X6的版本，应该是最新的，稍早一些的版本设置方法可能不太相同，但是原理应该类似
关掉自动编译索引后，最后统一手动 Update Citations and Bibliography 即可。